Poslanstvo Inštituta za geografske študije je oblikovanje razvojnih politik za obmejna območja oz.  območja družbenega in kulturnega stika na splošno, za turistične regije ter za območja prepletajočih in nasprotujočih se prostorskih interesov. Poseben poudarek dajemo stičnemu območju med Slovenijo, Italijo, Hrvaško in Avstrijo ter obalnemu območju severnega Jadrana.